Einen aktuellen und ausführlichen Vergleich von Literaturverwaltungsprogrammen bietet die Übersicht von Petra Frommer und Dorothea Lemke im digitalen Repositorium der TU München.
Update 30.8.2012: Die Übersicht wurde inzwischen aufgrund zahlreicher Hinweise von Benutzern noch einmal aktualisiert (gleicher Link).
(via Inetbib)